В 2014 году NED направил на поддержку российских некоммерческих организаций $ 9,3 млн. По сравнению с 2013 годом финансирование увеличено на $ 1,3 млн. Российское направление в фонде возглавлял отец вице-президента NED Нади Дюк — боец Украинской повстанческой армии Петро Дюк.
В 2013 году в РФ было профинансировано 85 организаций по девяти различным направлениям деятельности (борьба с коррупцией, гражданское образование, демократические идеи и ценности, свобода объединений, свобода информации, права человека, укрепление НПО, верховенство закона и укрепление политических институтов), а в 2014-м в список грантополучателей вошли 96 организаций.
В 2014 году российские НКО поделили на 10 категорий, появилась новая категория — «политические процессы». По ней две организации получили по $ 450 тыс. на проведение тренингов и семинаров среди локальных организаций для повышения их политической активности.
Согласно реестру министерства юстиции РФ, среди тех, кто в 2014 году получил финансирование от Национального фонда поддержки демократии: правозащитный центр «Мемориал», «Мемориальный центр истории политических репрессий „Пермь-36“» (весной 2015 г. прекратил деятельность), «Ресурсный правозащитный центр», «Общественная комиссия по сохранению наследия академика Сахарова», «Солдатские матери Санкт-Петербурга».
28 июля 2015 года в соответствии с федеральным законом «О нежелательных организациях» генпрокуратура РФ признала деятельность фонда нежелательной на территории России. Решение генпрокуратуры было направлено в министерство юстиции для включения фонда в соответствующий перечень. Национальный фонд поддержки демократии стал первой в РФ «нежелательной организацией».
Несмотря на это NED через ассоциированные организации продолжил свою деятельность в России. С 2016 года на проекты в России организация потратила более $ 21 млн. Основная часть расходов касалась поддержки активистов и программ, направленных на «развитие гражданского общества».
Большая часть проектов в России в 2019 году, согласно данным фонда, была направлена на развитие гражданского общества (около $ 650 тыс.). В частности, на «защиту активистов», включающую в себя мониторинг и «независимые» исследования судебных разбирательств, было потрачено $ 138 тыс.
Между тем на развитие «потенциала» российских активистов американским фондом было выделено $ 111 тыс. Как указывается в описании гранта, проект касался политических процессов в России, а сами деньги были направлены на поддержку общественных активистов «в их работе по решению системных проблем на местном уровне».
Другой грант ($ 35 тыс.), касающийся «местных лидеров организаций гражданского общества», был нацелен на создание платформы для разработки «демократических решений» локальных конфликтов. Почти $ 58 тыс. NED выделил на организацию общественных мероприятий и различных образовательных программ, направленных на продвижение «демократических ценностей».
В качестве отдельного проекта значилась инициатива по расширению возможностей активистов просвещать российскую молодежь о правах человека, в том числе гражданских. На это из американского бюджета было выделено $ 84 тыс.
На поддержку российского «демократического активизма в трудных условиях» NED направил $ 175 тыс. На поддержку «независимых СМИ» в России в 2019 году Национальный фонд в поддержку демократии потратил почти $ 183 тыс.
Порядка $ 56 тыс. было потрачено фондом на проект, посвященный «правам человека и исторической памяти». Согласно описанию гранта, эти средства были направлены на повышение осведомленности о проблемах гражданского общества и «улучшение понимания обществом роли политических репрессий в истории и современном обществе».
В рамках проекта проводилась работа по развитию информационных онлайн-ресурсов и «расширению доступа общественности к исторической информации».
Согласно докладу NED за 2017 год, в 2017-м вместе с располагающейся в Праге организацией Forum 2000 Национальный фонд в поддержку демократии помог организовать встречу ведущих писателей и активистов со всего мира. На собрании группа утвердила заявление, где в качестве главной угрозы демократии называются «возрождающиеся деспотические режимы» России и Китая. В качестве заслуг фонда за 2017 год, в частности, называлась «защита» информационного пространства в Европе и Евразии от России.
Также указывалось, что благодаря докладу Международного форума по демократическим исследованиям (который проводил NED) в отношении России и Китая появился термин «острая сила», так как главными целями Москвы и Пекина якобы является «пробитие, пронизывание политической и информационной среды и проникновение в нее в целевых странах». Этот термин, подчеркивали в фонде, стал широко использоваться рядом СМИ.
С 2015 года фонд стал активно поддерживать организации и структуры по всей Европе в борьбе с «российской дезинформацией». В 2017 году NED выделил $ 1,5 млн на проекты в Европе по поддержке СМИ и расследовательской журналистики, занимающихся созданием, публикацией и «усилением значимости» контента о «дезинформации Кремля».
Национальный фонд в поддержку демократии также занимается финансовой поддержкой организаций, признанных нежелательными в России. В одном из налоговых документов NED за 2016 год (2017-й финансовый, который длился с 1 октября 2016 года до 30 сентября 2017 года) указано, что фонд перечислил $ 46 тыс. Институту современной России Павла Ходорковского (сын Михаила Ходорковского). НКО была зарегистрирована в США.
В том же году NED выделил $ 252 тыс. фонду «Свободная Россия», который Министерство юстиции РФ включило в перечень иностранных неправительственных организаций, деятельность которых признана в РФ нежелательной.