С 2016 года Фонд Фридриха Науманна совместно с Фондом Бориса Немцова за Свободу вручает «Премию Бориса Немцова» «за исключительную отвагу в борьбе за демократические ценности и права человека». Ее лауреатами становились политик Лев Шлосберг, гражданский активист Ильдар Дадин, участница движения «Солидарность» Надежда Митюшкина, член совета «Открытой России» Анастасия Шевченко.
Свою активную деятельность за границей Фонд ведет
с начала 1960-х годов: международные форумы, программы для журналистов и экономистов, коллоквиумы по темам гражданских прав и либеральных ценностей в Латинской Америке, Африке, Восточной Европе.
В июне 1989 года Фонд открыл свое бюро в Венгрии. Совсем скоро пала Берлинская стена и Фонд быстро отреагировал на ситуацию.
В 1990 году появились бюро в Варшаве и Праге, затем ― в Таллине, Братиславе, Любляне и Риге.
В 1992 году Фонд Фридриха Науманна открыл свое бюро в Москве.
В апреле 2022 года Минюст России опубликовал сообщение о лишении регистрации в России представительств нескольких иностранных аналитических центров, фондов и правозащитных организаций. В их число попали Московский центр Карнеги, представительства правозащитных организаций, фондов, связанных с немецкими политическими партиями, и ряда других структур. В список попал и Фонд Фридриха Науманна.
Как говорилось в сообщении Минюста РФ, все они были лишены регистрации в связи с выявленными нарушениями действующего законодательства.
Минюст лишил регистрации Московский центр Карнеги (представительство американского Фонда Карнеги за международный мир), представительства правозащитных организаций
Human Rights Watch (головная структура – в США) и Amnesty International (головная структура в Великобритании), германские фонды, ассоциированные с политическими партиями, – Фонд Фридриха Науманна (Свободная демократическая партия),
Фонд им. Фридриха Эберта (Социал-демократическая партия), Фонд Ханса Зайделя (ХДС/ХСС), Фонд Розы Люксембург (партия «Левые») и Фонд им. Генриха Бёлля («Зеленые»). Также регистрация была отобрана еще у двух немецких организаций – филиала объединения
«Конрад-Аденауэр-Штифтунг», представительства Немецкого научно-исследовательского сообщества в Российской Федерации, швейцарского Фонда Ага Хана (главы общины исмаилитов, которые составляют население Горно-Бадахшанской автономной области Таджикистана), а также польской ассоциации «Вспульнота польска» и американского Института международного образования.